Siti Atiqoh menempuh pendidikan di Fakultas Teknologi Pertanian Universitas Gadjah Mada Yogyakarta pada tahun 1990-1997. Ia kemudian melanjutkan studi di Universitas Tokyo dengan mengambil program studi Kebijakan Publik.
Menikah dengan Ganjar pada tahun 1999, keduanya dikaruniai seorang putra bernama Muhammad Zinedine Alam Ganjar.
Atiqoh bekerja menjadi wartawan di Harian Umum Solopos, sebuah media lokal di Solo, Jawa Tengah,
Ketika sedang menempuh studi di Universitas Gadjah Mada, Siti Atiqoh sempat bekerja menjadi wartawan di Harian Umum Solopos. Pada tahun yang sama dengan pernikahannya, ia mendaftar sebagai calon pegawai negeri sipil untuk penempatan di Purbalingga.